MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 32433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021006	TTAT	2	8	28	35	25 %	75 %	0 %	0 %	480532169
2	NC_021006	GAT	2	6	84	89	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532169
3	NC_021006	GAA	2	6	100	105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532169
4	NC_021006	CAG	2	6	152	157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532169
5	NC_021006	GAA	2	6	196	201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532169
6	NC_021006	CT	3	6	236	241	0 %	50 %	0 %	50 %	480532169
7	NC_021006	CAG	2	6	245	250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532169
8	NC_021006	GTA	3	9	301	309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532169
9	NC_021006	ATA	2	6	311	316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532169
10	NC_021006	GTT	2	6	352	357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532169
11	NC_021006	TGCC	2	8	402	409	0 %	25 %	25 %	50 %	480532169
12	NC_021006	CAA	2	6	419	424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532169
13	NC_021006	ATG	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532169
14	NC_021006	ATG	2	6	563	568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532169
15	NC_021006	GGT	2	6	610	615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532169
16	NC_021006	AGATGA	2	12	695	706	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	480532169
17	NC_021006	GAT	2	6	733	738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532169
18	NC_021006	TG	3	6	760	765	0 %	50 %	50 %	0 %	480532169
19	NC_021006	AAG	2	6	815	820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532169
20	NC_021006	GAA	2	6	832	837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532169
21	NC_021006	AGC	2	6	843	848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532169
22	NC_021006	GAT	2	6	880	885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532169
23	NC_021006	TCA	2	6	891	896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532169
24	NC_021006	TTG	2	6	941	946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532169
25	NC_021006	GTT	2	6	994	999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532169
26	NC_021006	TGC	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532169
27	NC_021006	TTA	2	6	1209	1214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532170
28	NC_021006	TTGA	2	8	1262	1269	25 %	50 %	25 %	0 %	480532170
29	NC_021006	CAT	2	6	1283	1288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532170
30	NC_021006	TTC	2	6	1299	1304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532170
31	NC_021006	CTG	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532170
32	NC_021006	GAG	2	6	1346	1351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532170
33	NC_021006	GTT	2	6	1357	1362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532170
34	NC_021006	AAG	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532170
35	NC_021006	TGG	2	6	1468	1473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532170
36	NC_021006	TAC	2	6	1502	1507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532170
37	NC_021006	AAG	2	6	1521	1526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532170
38	NC_021006	ATT	2	6	1574	1579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532170
39	NC_021006	TTGA	2	8	1700	1707	25 %	50 %	25 %	0 %	480532170
40	NC_021006	CCATG	2	10	1759	1768	20 %	20 %	20 %	40 %	480532170
41	NC_021006	GAA	2	6	1861	1866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532170
42	NC_021006	GCA	2	6	1871	1876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532170
43	NC_021006	ATTC	2	8	1888	1895	25 %	50 %	0 %	25 %	480532170
44	NC_021006	CT	3	6	1908	1913	0 %	50 %	0 %	50 %	480532170
45	NC_021006	AGA	3	9	2005	2013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532170
46	NC_021006	TAA	2	6	2099	2104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532170
47	NC_021006	TGA	2	6	2183	2188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532171
48	NC_021006	AGC	2	6	2199	2204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532171
49	NC_021006	AGTCA	2	10	2241	2250	40 %	20 %	20 %	20 %	480532171
50	NC_021006	AAGT	2	8	2353	2360	50 %	25 %	25 %	0 %	480532171
51	NC_021006	AGA	2	6	2393	2398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532171
52	NC_021006	GTT	2	6	2400	2405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532171
53	NC_021006	TTA	2	6	2509	2514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532171
54	NC_021006	AAT	2	6	2520	2525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532171
55	NC_021006	AAG	2	6	2550	2555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532171
56	NC_021006	TGTC	2	8	2557	2564	0 %	50 %	25 %	25 %	480532171
57	NC_021006	CAGT	2	8	2570	2577	25 %	25 %	25 %	25 %	480532171
58	NC_021006	TAG	2	6	2598	2603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532171
59	NC_021006	T	6	6	2628	2633	0 %	100 %	0 %	0 %	480532171
60	NC_021006	ATC	2	6	2664	2669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532171
61	NC_021006	TCAA	2	8	2692	2699	50 %	25 %	0 %	25 %	480532171
62	NC_021006	GTT	2	6	2796	2801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532171
63	NC_021006	ACG	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532171
64	NC_021006	TCT	2	6	2924	2929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532171
65	NC_021006	AGT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532171
66	NC_021006	CAT	3	9	2960	2968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532171
67	NC_021006	GAT	2	6	3105	3110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532171
68	NC_021006	A	6	6	3154	3159	100 %	0 %	0 %	0 %	480532171
69	NC_021006	TAGC	2	8	3209	3216	25 %	25 %	25 %	25 %	480532171
70	NC_021006	ATA	2	6	3265	3270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532171
71	NC_021006	AAT	2	6	3348	3353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532171
72	NC_021006	TGGC	2	8	3373	3380	0 %	25 %	50 %	25 %	480532171
73	NC_021006	CTGT	2	8	3430	3437	0 %	50 %	25 %	25 %	480532171
74	NC_021006	AGC	2	6	3489	3494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532171
75	NC_021006	TAAT	2	8	3533	3540	50 %	50 %	0 %	0 %	480532171
76	NC_021006	AGCT	2	8	3651	3658	25 %	25 %	25 %	25 %	480532172
77	NC_021006	AAGT	2	8	3686	3693	50 %	25 %	25 %	0 %	480532172
78	NC_021006	TGA	3	9	3711	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532172
79	NC_021006	CAG	2	6	3726	3731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532172
80	NC_021006	CTTT	2	8	3786	3793	0 %	75 %	0 %	25 %	480532172
81	NC_021006	GCGT	2	8	3801	3808	0 %	25 %	50 %	25 %	480532172
82	NC_021006	AAAT	2	8	3814	3821	75 %	25 %	0 %	0 %	480532172
83	NC_021006	ATA	2	6	3839	3844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532172
84	NC_021006	TCC	2	6	3848	3853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532172
85	NC_021006	TTC	2	6	3866	3871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532172
86	NC_021006	GAG	2	6	4041	4046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532173
87	NC_021006	GTCGA	2	10	4109	4118	20 %	20 %	40 %	20 %	480532173
88	NC_021006	GCCCT	2	10	4132	4141	0 %	20 %	20 %	60 %	480532173
89	NC_021006	AAC	2	6	4154	4159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532173
90	NC_021006	CCA	2	6	4238	4243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532173
91	NC_021006	TGG	2	6	4472	4477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532173
92	NC_021006	ATT	2	6	4510	4515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532173
93	NC_021006	GAA	2	6	4542	4547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532173
94	NC_021006	AGA	2	6	4579	4584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
95	NC_021006	GAA	2	6	4592	4597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
96	NC_021006	AGA	2	6	4663	4668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
97	NC_021006	TCG	2	6	4728	4733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532174
98	NC_021006	GAT	2	6	4744	4749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532174
99	NC_021006	GAA	2	6	4778	4783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
100	NC_021006	CAAG	2	8	4789	4796	50 %	0 %	25 %	25 %	480532174
101	NC_021006	AGA	2	6	4822	4827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
102	NC_021006	GAA	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
103	NC_021006	ATC	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532174
104	NC_021006	AGC	2	6	4906	4911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532174
105	NC_021006	TGG	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532174
106	NC_021006	GGT	2	6	5024	5029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532174
107	NC_021006	AAG	2	6	5034	5039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
108	NC_021006	CGACAG	2	12	5151	5162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532174
109	NC_021006	CTGGTG	2	12	5241	5252	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	480532174
110	NC_021006	CCAA	2	8	5300	5307	50 %	0 %	0 %	50 %	480532174
111	NC_021006	GAA	2	6	5327	5332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
112	NC_021006	CAG	2	6	5339	5344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532174
113	NC_021006	ACC	2	6	5508	5513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532174
114	NC_021006	AGA	2	6	5611	5616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
115	NC_021006	AAT	2	6	5625	5630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532174
116	NC_021006	ATT	2	6	5643	5648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532175
117	NC_021006	GAA	2	6	5659	5664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532175
118	NC_021006	CT	3	6	5698	5703	0 %	50 %	0 %	50 %	480532175
119	NC_021006	ATCT	2	8	5726	5733	25 %	50 %	0 %	25 %	480532175
120	NC_021006	CAG	2	6	5758	5763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532175
121	NC_021006	ACA	2	6	5770	5775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532175
122	NC_021006	GAA	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532175
123	NC_021006	AGA	2	6	5796	5801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532175
124	NC_021006	AGC	2	6	5817	5822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532175
125	NC_021006	CAT	2	6	5841	5846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532175
126	NC_021006	A	6	6	6015	6020	100 %	0 %	0 %	0 %	480532175
127	NC_021006	CAG	3	9	6041	6049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532175
128	NC_021006	AAAATC	2	12	6092	6103	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	480532175
129	NC_021006	T	6	6	6112	6117	0 %	100 %	0 %	0 %	480532175
130	NC_021006	A	6	6	6118	6123	100 %	0 %	0 %	0 %	480532175
131	NC_021006	TC	3	6	6185	6190	0 %	50 %	0 %	50 %	480532175
132	NC_021006	CT	3	6	6245	6250	0 %	50 %	0 %	50 %	480532175
133	NC_021006	TGG	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532175
134	NC_021006	CAAG	2	8	6348	6355	50 %	0 %	25 %	25 %	480532175
135	NC_021006	A	8	8	6395	6402	100 %	0 %	0 %	0 %	480532175
136	NC_021006	TGA	2	6	6450	6455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532175
137	NC_021006	TGG	2	6	6484	6489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532176
138	NC_021006	CGT	2	6	6578	6583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532176
139	NC_021006	CTCAAT	2	12	6599	6610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532176
140	NC_021006	CAGC	2	8	6650	6657	25 %	0 %	25 %	50 %	480532176
141	NC_021006	ATT	2	6	6704	6709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532176
142	NC_021006	GA	3	6	6807	6812	50 %	0 %	50 %	0 %	480532176
143	NC_021006	TCAGG	2	10	6845	6854	20 %	20 %	40 %	20 %	480532176
144	NC_021006	GTG	2	6	6858	6863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532176
145	NC_021006	GAG	2	6	7043	7048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532176
146	NC_021006	CTAG	2	8	7155	7162	25 %	25 %	25 %	25 %	480532177
147	NC_021006	CAT	2	6	7179	7184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532177
148	NC_021006	CAAGGT	2	12	7311	7322	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	480532177
149	NC_021006	TAC	2	6	7336	7341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532177
150	NC_021006	AAG	2	6	7354	7359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532177
151	NC_021006	ATC	2	6	7402	7407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532177
152	NC_021006	GAT	2	6	7564	7569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532178
153	NC_021006	ATG	2	6	7580	7585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532178
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155	NC_021006	CAA	2	6	7624	7629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532178
156	NC_021006	AAT	2	6	7630	7635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532178
157	NC_021006	AAAT	2	8	7704	7711	75 %	25 %	0 %	0 %	480532178
158	NC_021006	TTA	2	6	7737	7742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532178
159	NC_021006	TGG	2	6	7743	7748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532178
160	NC_021006	GTA	2	6	7756	7761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532178
161	NC_021006	TTGA	2	8	7873	7880	25 %	50 %	25 %	0 %	480532178
162	NC_021006	GGT	2	6	7918	7923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532178
163	NC_021006	AAG	2	6	8039	8044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532178
164	NC_021006	TGG	2	6	8144	8149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532178
165	NC_021006	TGGTT	2	10	8166	8175	0 %	60 %	40 %	0 %	480532178
166	NC_021006	CAA	3	9	8219	8227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532178
167	NC_021006	GTG	2	6	8255	8260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532178
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169	NC_021006	A	7	7	8293	8299	100 %	0 %	0 %	0 %	480532178
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172	NC_021006	AAG	2	6	8375	8380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532178
173	NC_021006	TGC	2	6	8406	8411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532178
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176	NC_021006	TTG	2	6	8507	8512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532178
177	NC_021006	TAAA	2	8	8579	8586	75 %	25 %	0 %	0 %	480532178
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245	NC_021006	CGT	2	6	12120	12125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532182
246	NC_021006	ATTG	2	8	12194	12201	25 %	50 %	25 %	0 %	480532182
247	NC_021006	TGTC	2	8	12232	12239	0 %	50 %	25 %	25 %	480532182
248	NC_021006	A	7	7	12428	12434	100 %	0 %	0 %	0 %	480532182
249	NC_021006	GAT	2	6	12435	12440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532182
250	NC_021006	AAG	2	6	12502	12507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532182
251	NC_021006	A	8	8	12549	12556	100 %	0 %	0 %	0 %	480532182
252	NC_021006	GAA	2	6	12617	12622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532182
253	NC_021006	CAAC	2	8	12642	12649	50 %	0 %	0 %	50 %	480532182
254	NC_021006	TCC	2	6	12665	12670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532182
255	NC_021006	AAGC	2	8	12700	12707	50 %	0 %	25 %	25 %	480532182
256	NC_021006	ATCGC	2	10	12724	12733	20 %	20 %	20 %	40 %	480532182
257	NC_021006	GAA	2	6	12803	12808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532182
258	NC_021006	AGCAA	2	10	12939	12948	60 %	0 %	20 %	20 %	480532182
259	NC_021006	TCAAA	2	10	12956	12965	60 %	20 %	0 %	20 %	480532182
260	NC_021006	TA	3	6	13006	13011	50 %	50 %	0 %	0 %	480532182
261	NC_021006	A	6	6	13022	13027	100 %	0 %	0 %	0 %	480532182
262	NC_021006	ACA	2	6	13057	13062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532182
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264	NC_021006	AGA	2	6	13109	13114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532182
265	NC_021006	CAT	2	6	13118	13123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532182
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